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近日,網(wǎng)曝復(fù)旦大學(xué)某呂姓博士論文數(shù)據(jù)造假,同門師弟無法重復(fù)數(shù)據(jù)。本文僅限轉(zhuǎn)載,而且此事已過去10年之久,為何此時(shí)曝出,尚有疑問,具體調(diào)查結(jié)果以官方為準(zhǔn)。
我是在2010年10月正式進(jìn)入趙**在上海植生所的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行博士后研究。我沒有想到的是這段博后時(shí)光卻成為我科研人生的一段噩夢。我進(jìn)站之后做的第一個(gè)課題是順著趙**在復(fù)旦大學(xué)招收的博士生呂**在博士期間發(fā)表的文章往下做。該文章刊登在JBC (2010) 285: 28076-28085。
圖 1 呂**JBC文章的題目及相關(guān)圖(原文中的圖4)
我的課題計(jì)劃是研究在M. smegmatis菌中mazG基因在氧化壓力下受同一操縱子基因tetR轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子機(jī)制,目的是想看mazG的表達(dá)在H2O2氧化條件下是否受到TetR的調(diào)控。然而,從2010年的9月份一直到2011年的3月份,我一直無法重復(fù)出呂**JBC文章中圖4的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖1),也就是說,我沒有看到mazG和relA在H2O2刺激下表達(dá)增加。隨后,呂**自己重復(fù)了3次也沒有重復(fù)出他的結(jié)果(其中兩次是我跟隨他一起做的)。隨后我決定采用在H2O2刺激下高表達(dá)的基因katG和furA作為陽性對照來繼續(xù)驗(yàn)證他的實(shí)驗(yàn),我發(fā)現(xiàn)在我能夠重復(fù)出katG和furA在氧化條件下(5mM或10mM H2O2)高表達(dá)的同時(shí),mazG和relA依然沒有出現(xiàn)高表達(dá)(圖2A)。我把我的實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)給趙**及實(shí)驗(yàn)室其他人之后,大家立刻明白是怎么回事了,但趙**只是終止了這個(gè)項(xiàng)目,沒有撤稿,也沒有公開承認(rèn)呂**偽造實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。實(shí)驗(yàn)室大小負(fù)責(zé)人多次暗示或明確表示我(們)不要把這個(gè)事情張揚(yáng)出去。趙**在2011年9月份給我的郵件中明確暗示了呂**的文章有問題。

圖 2 (A)我在2011年的RT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果,結(jié)果顯示katG和furA在H2O2誘導(dǎo)下高表達(dá),而mazG和relA并沒有出現(xiàn)高表達(dá),反而是一定程度的降低表達(dá)。(B)我從PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)做出來的直方圖,同樣顯示mazG和relA在H2O2誘導(dǎo)下表達(dá)是降低,而不是增高的。
從2010年9月-2011年9月,我重復(fù)了大約40次左右實(shí)驗(yàn),作者本人呂**重復(fù)了3次,都沒有一次能夠重復(fù)出JBC文章中的結(jié)果。每次重復(fù)我都是從培養(yǎng)M. smegmatis開始,H2O2誘導(dǎo),抽提RNA,做反轉(zhuǎn)錄,然后做RT-PCR或者熒光定量PCR,一輪下來,差不多快一周時(shí)間,每次抽提RNA都會(huì)用到很多有一定毒性的試劑:苯酚和氯仿,我真的抽得快要吐血了。另外,呂**在他自己進(jìn)行重復(fù)他的實(shí)驗(yàn)結(jié)果之前(也就是我要跟隨他一起去上海市公共衛(wèi)生中心做這些實(shí)驗(yàn)之前)的某一天,突然他打電話給我,大意是說我這樣做對他不好,學(xué)校知道了會(huì)怎樣怎樣的。當(dāng)時(shí)我只是覺得他說的話很蹊蹺,并沒有多想。在整個(gè)過程中,呂**拒絕給我看他的博士論文和任何實(shí)驗(yàn)記錄。該項(xiàng)目之后,我在趙**實(shí)驗(yàn)室做的第二個(gè)項(xiàng)目在已經(jīng)做了很長時(shí)間并有部分實(shí)驗(yàn)結(jié)果的情況下突然無緣無故被終止,其目的就是讓我在科研上起不來,從而也就不敢向外界公開此事。而呂**在兩輪博士后結(jié)束之后,以一篇并列第一作者(排第2位置)的PLoS ONE (2008),一篇數(shù)據(jù)造假的JBC和一篇并列第一作者的PLoS Pathogens (2013),于2015年9月在趙**的安排下進(jìn)入復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院任副教授至今。

圖3 (A)mazG所在操縱子示意圖,在氧化條件下,TetR結(jié)合在自己的啟動(dòng)子上抑制mazG-mfd-tetR的表達(dá)(FEBS Letters文章已證實(shí))。(B)我從PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)做出來的直方圖,進(jìn)一步說明了在氧化條件下mazG-mfd-tetR是低表達(dá)的。(C)是FEBS Letters 594(17): 2867-2880文章通過實(shí)驗(yàn)說明了雖然mazG在氧化條件下對M. smegmatis具有一定的保護(hù)作用,但同時(shí)也說明了在氧化條件下,mazG的表達(dá)是受TetR (Rv1019)抑制的。
幸運(yùn)的是,該事情過去近10年間,我查閱到有兩篇文章直接支持了我的結(jié)果,進(jìn)一步說明了呂**在JBC文章中數(shù)據(jù)造假。這些文章也讓我有更多的勇氣來向大眾陳述揭發(fā)此事。在2015年,中科院微生物所課題組發(fā)表在PLoS ONE 10(7): e0134596上的文章“Distinct Responses of Mycobacterium smegmatis?to Exposure to Low and High Levels of Hydrogen Peroxide”進(jìn)一步提供了直接的證據(jù)。作者采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)的方法研究在低濃度(0.2 mM)和高濃度(7 mM)H2O2誘導(dǎo)條件下M. smegmatis體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄情況。該研究結(jié)果顯示,在7 mM H2O2誘導(dǎo)條件下,katG和furA高表達(dá),而mazG和relA并沒有出現(xiàn)高表達(dá)(圖2B)。這個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步支持我的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,同時(shí)也說明了呂**JBC文章圖4的結(jié)論完全是偽造的。
2020年,F(xiàn)EBS Letters 594(17): 2867-2880上發(fā)表了“Mycobacterium tuberculosis?TetR family transcriptional regulator Rv1019 is a negative regulator of the?mfd–mazG?operon encoding DNA repair proteins.” 這篇文章主要內(nèi)容其實(shí)就是我原本在2010年博士后階段要做的那個(gè)課題,終于該課題在2020年被印度的一個(gè)實(shí)驗(yàn)室完成了。在該論文中,作者發(fā)現(xiàn)在M. smegmatis體內(nèi),TetR結(jié)合到它自己的啟動(dòng)子上,負(fù)調(diào)控tetR–mfd–mazG操縱子表達(dá)(圖3A)。并且,作者還發(fā)現(xiàn)雖然mazG對于M. smegmatis在氧化條件下的生存有一定的幫助,但是在氧化條件下TetR是結(jié)合在它自己的啟動(dòng)子上的,因而mazG的表達(dá)會(huì)降低(圖3C-D)。這個(gè)結(jié)論同樣得到前述2015年P(guān)LoS ONE上文章的支持,在氧化條件下,tetR-mfd-mazG的表達(dá)是都降低的(圖3B)。這個(gè)證據(jù)進(jìn)一步直接證明了那篇JBC文章上圖4的實(shí)驗(yàn)結(jié)果是不可能發(fā)生的。
那篇JBC文章發(fā)表10年過去了,我查看了所有引用那篇文章的研究論文,沒有一篇文章證實(shí)在氧化條件下,M. smegmatis體內(nèi)的mazG和relA會(huì)高表達(dá)。不僅如此,對于所有研究Mycobacterium這個(gè)種屬mazG基因的相關(guān)論文,我也沒有看到有報(bào)道其在氧化環(huán)境下會(huì)高表達(dá)。
這段經(jīng)歷雖然過去大約10年了,但是對我的傷害可以說是巨大的。你們可以想象,師兄論文造假,師弟卻在那里一遍又一遍的重復(fù),長時(shí)間地呼吸著苯酚和氯仿的有毒刺激性氣味,重復(fù)不出來,他就說你的實(shí)驗(yàn)技術(shù)不行。最后做出來了陽性結(jié)果,課題嘎然而止,造假者不僅沒有得到懲治,卻對我是百般欺壓。你們告訴我,人性的底線在哪里?一個(gè)師兄挖了一個(gè)坑,然后師弟無意之中掉入了他挖的坑里,他每天看著你在坑里掙扎,這是人做的事情嗎?如果一個(gè)人的人性如此之壞,做科研的意義是什么?在高校從事教育工作的意義是什么?
每每想起此事,我的心頭就象是壓著一塊巨石一樣,眼淚常常不由自主地就留下來。所以,我愿意把這段經(jīng)歷公之于眾,讓大家來評(píng)判,讓大家來吸取教訓(xùn)。事件結(jié)果受到傷害的只有我和科學(xué),科學(xué)不會(huì)說話,那就讓我來說吧。
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