來(lái)源丨化學(xué)寶庫(kù) 美國(guó)斯克里普斯研究所（TSRI）年輕的有機(jī)化學(xué)大牛Phil. S.Baran課題組發(fā)明了一種讓復(fù)雜有機(jī)分子耦合的新方法，并合成了60多種新的化合物，其中90%為新化…

CP2K的安裝 1.1?直接使用二進(jìn)制版本 CP2K的安裝有很多種方法。最簡(jiǎn)單的方法是直接使用預(yù)編譯版本的二進(jìn)制可執(zhí)行文件。 用戶可以選擇從發(fā)行版所帶的軟件源安裝預(yù)編譯版本的CP2…

在采用intel的ifort編譯支持hybrid functional計(jì)算的CP2K時(shí)，盡管編譯得到了cp2k.popt的可執(zhí)行模塊，但是在運(yùn)行時(shí)常遇到如下的錯(cuò)誤： HFX_MEM…

CP2K的功能很多，其輸入文件的結(jié)構(gòu)也比Gaussian或者VASP等常見(jiàn)的計(jì)算化學(xué)軟件更加復(fù)雜。這里，我直接給出各種CP2K輸入文件作為例子，并說(shuō)明其輸入文件中各種參數(shù)的設(shè)置。 …

? 一個(gè)明顯的事實(shí)是：現(xiàn)在有兩種“計(jì)算”，而相應(yīng)的科研人群也大體上分為兩大類。一部分人做固體材料的計(jì)算，包括表面和催化在內(nèi)，主要使用密度泛函理論（DFT）；而另一部分人做[量子化學(xué)…

一、簡(jiǎn)介；本部分大至介紹了LAMMPS的一些功能和缺陷； 1．什么是LAMMPS?；LAMMPS是一個(gè)經(jīng)典的分子動(dòng)力學(xué)軟件；LAMMPS是一可以修改和擴(kuò)展的計(jì)算程序； 2．LAMM…

【作者前言】 對(duì)于科技工作者來(lái)說(shuō)，gnuplot 是一個(gè)非常好用的繪圖軟件。因?yàn)楦锌趃nuplot 中文資料和文檔的缺乏，我于數(shù)月之前在科學(xué)網(wǎng)博客開(kāi)始撰寫(xiě)“談?wù)刧nuplot”系…

近二十年來(lái)，機(jī)器學(xué)習(xí)方法的發(fā)展為我們的生活帶來(lái)了許多便利。智能網(wǎng)絡(luò)搜索、語(yǔ)音識(shí)別，乃至無(wú)人超市、無(wú)人駕駛汽車等，依托于機(jī)器學(xué)習(xí)方法的新事物正迅速地在我們的生活中普及。Alpha G…

這個(gè)命令是設(shè)置初始狀態(tài)常用命令，經(jīng)典命令格式【fix 1 all nve/limit 0.1】，我們一般直接用即可【LJ單位下】，注意此命令只能模擬開(kāi)始使用，真正需要記錄模擬信息時(shí)…

【作者前言】 對(duì)于科技工作者來(lái)說(shuō)，gnuplot 是一個(gè)非常好用的繪圖軟件。因?yàn)楦锌趃nuplot 中文資料和文檔的缺乏，我于數(shù)月之前在科學(xué)網(wǎng)博客開(kāi)始撰寫(xiě)“談?wù)刧nuplot”系…